Do tinh dầu là một hỗn hợp các loại hợp chất khác nhau nên khi tiếp xúc với oxy, một số thành phần sẽ xảy ra các phản ứng hóa học không cần thiết, làm biến đổi thành phần của tinh dầu. Vì thế nó sẽ khiến tinh dầu mất đi những tác dụng trị liệu vốn có đồng thời dễ gây ra những tác hại tiêu cực.
Một nghiên cứu đã chỉ ra rằng khi tinh dầu chanh tươi tiếp xúc với không khí hằng ngày sẽ khiến 66.4% hàm lượng monoterpene bị hao hụt sau 12 tháng. Và khi tinh dầu chanh tươi ít tiếp xúc hơn thì số liệu này đã giảm đáng kể.
Ánh sáng cũng là một yếu tố quan trọng gây ảnh hưởng nhiều đến với tinh dầu. Do tia cực tím có trong ánh sáng khi tiếp xúc với tinh dầu sẽ làm phá hủy các phân tử vốn có, khiến cho một số hợp chất mất đi và một số hợp chất tăng lên, làm ảnh hưởng đến chất lượng của tinh dầu.
Bên cạnh ánh sáng thì nhiệt độ cũng là một yếu tố cực kỳ quan trọng cần lưu ý vì nó là nguyên nhân chính trong quá trình oxy hóa của tinh dầu khiến cho tinh dầu dễ bị bay hơi hơn.
Vì thế tinh dầu cần được bảo quản ở nhiệt độ thấp và ổn định để có thể sử dụng được lâu hơn, nhiệt độ thích hợp nhất để bảo quản tinh dầu là từ 2 – 5 độ C.
